纯化水在药品及医疗器械行业得到了广泛运用，例如疫苗生产、药品生产、体外诊断试剂以及各类医用耗材用水等都有纯化水的参与。
为什么纯化水会被广泛用于医药行业？我们以药品为例进行讲解，因为普通自来水中有很多杂质是没办法和药品分离开的，所以必须使用纯化水，否则药品就会被污染。
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药品大都是是通过发酵形成的，开始的时候是充满发酵细菌跟原料的液体。这些液体通过微滤膜进行过滤。除掉发酵的细菌与残余原料，剩下纯净的、澄清的含药品物质的溶液。 在这过程中为了尽量保留组成药品的物质，会多次加水，进行循环过滤。
如果用自来水就会把杂质引入，因为当这些澄清的溶液用超滤或离子交换系统进行有用物质的富集，去水这个过程里自来水中的很多杂质是没办法去除的，会和药品中的有用物质一起富集起来，从而造成药品污染，所以制药必须用纯化水。
不管是什么药物在生产过程中都有几步是液态的，由上可知使用纯化水是为了减少药物的内毒素含量，所以纯化水被广泛用于制药过程，此外需提醒的是如果是注射针剂类的药物，那全程使用的则都必须是注射用水。
